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小RNA测序寻找疾病相关Biomarker方案

简介

肿瘤是一种十分难以治疗的疾病,尤其是恶性肿瘤,在发病的中后期缺乏有效的治疗手段,而恶性肿瘤在发现的时候往往就已经是中期甚至是晚期,在我国 80%的癌症患者确诊时即属于中晚期,癌症一旦出现转移或进入中晚期就变成了急性病,晚期肺癌一般存活期只有一年,而肝癌晚期出现黄疸和腹水等临床表征后存活期一般只有1-3 个月,如果恶性肿瘤早期发现仍然是有较高的治愈率的。但目前我国癌症防治的现状是,患者在确诊时通常都不是早期,因此,肿瘤早期的诊断对于患者至关重要,并直接决定着患者的治疗方案甚至存活与否。

近年来,小RNA被发现与肿瘤的发生以及发展有着重要的联系。作为一种全新的调控因子,小RNA以序列特异性作用方式调控基因的表达过程,并影响了各种生命进程。小RNA在不同个体的血液中的表达水平十分稳定,而任何小RNA的异常表达都可能预示着机体病变的发生。所以,小RNA可以作为肿瘤以及其他疾病的早期诊断的biomarker。

技术流程

图1. 小RNA测序寻找Biomarker流程图

云蜂案例介绍

血液小RNA:癌症及其他疾病诊断的Biomarker

不同组织的小RNA表达异常通常与各种疾病相关,本文通过对人、小鼠、大鼠、牛、马等物种的血清和血浆的小RNA进行分析发现同一物种不同个体的的血清小RNA表达量一致性很高。本研究通过高通量测序测定了健康中国人个体血清小RNA的表达量,并分别分析了肺癌、结直肠癌和糖尿病病人的血清小RNA特异表达情况,证明不同疾病患者的血清小RNA有独有的表达水平。利用高通量测序的手段,两个小RNA分子被证实与非小细胞肺癌有紧密联系,并在后续验证实验中也证实了这一现象。该研究清晰的阐明了血清小RNA的表达水平有着高稳定性、高重复性以及同物种不同个体间的高度一致性,因此血清中的小RNA可以作为各种癌症以及其他疾病无创诊断的新型Biomarker分子。

图2. 正常血浆和肺癌血浆小RNA表达量比较
NS:正常血浆;LCS肺癌血浆。可以看出两种样品类型其小RNA的表达量有明显的差异。

参考文献

[1].Characterization of microRNAs in serum: a novel class of biomarkers for diagnosis of cancer and other diseases. Cell Res. 2008 Oct;18(10):997-1006. doi: 10.1038/cr.2008.282.